Агароза IEF с низким электроэндосмозом (ЭЭО) рекомендуется для большинства применений ДНК / РНК. Если отдельные нуклеиновые кислоты должны использоваться в качестве субстратов для ферментов (например, лигаза и рестрикционные эндонуклеазы), следует использовать специальную высокоочищенную агарозу, такую как Агароза NA.
Для препаративной работы следует использовать агарозу с низкой температурой гелеобразования. Agarose Prep имеет как низкие температуры плавления, так и точки гелеобразования.