Применение маркеров ДНК GeneRuler

Маркеры длин ДНК Thermo Scientific GeneRuler идеально подходят для определения размеров и приблизительного количественного анализа широкого спектра двухцепочечных ДНК. Маркеры доступны с размерами фрагментов от 10 п.о. до 48,5 кб.

Самыми популярными готовыми к использованию маркерами GeneRuler являются удобная смесь с загрузочным буфером Thermo Scientific TriTrack, который содержит три отслеживающих красителя (ксилолцианол FF, бромфеноловый синий и оранжевый G), которые помогают отслеживать разделение широкого диапазона размеров фрагментов ДНК.Примеры ДНК маркеров

Особенности

  • Более экологичное производство без использования органических растворителей
  • Обычные и готовые к использованию форматы
  • Широкий ассортимент предлагаемых размеров (1 кб, 100 л.с., 50 л.с., низкий и высокий диапазон).
  • Четкие и яркие контрольные полосы
  • Поставляется с загрузочным красителем для образцов ДНК
  • Доставка при температуре окружающей среды

Применение

Маркеры длин ДНК GeneRuler используются для определения размеров и приблизительного количественного определения в традиционных методах молекулярной биологии:

  • клонирование ДНК
  • ПЦР
  • Обратная транскрипция

Доступные размеры фрагментов: 1 кб, 50 бп, 100 бп, ультранизкий, низкий и высокий диапазон. Форматы: Плюс (Plus), готовые к использованию (ready-to-use), экспресс (Express) и микс (Mix).

Как выбрать правильные маркеры?

Ready-to-use (RTU) Вам необходимо удобство - они предварительно смешаны с буфером загрузки ДНК и красителями для слежения
Plus Вам необходимо визуализировать более широкий спектр фрагментов ДНК.
Ultra low и low range Требуется приблизительное количественное определение и определение размеров низкомолекулярных фрагментов ДНК, или анализ siRNA (ultra low)
High range Требуется быстрое определение размеров высокомолекулярных фрагментов ДНК (1,5 часа в 0,4% агарозного геля).
Express Вам необходимо быстрое разделение (5-15 мин при 23 В/см) при широком диапазоне условий, включая различные буферы, напряжение или процентные соотношения гелей
Mix Вам нужен маркер ДНК с высокой плотностью полосы ДНК для точного определения размера целевой ДНК

Протоколы

Обычные маркеры Готовые к использованию (ready-to-use)
Шаг 1
Компоненты Агароза Полиакриламид
ДНК маркер 1-2 мкл 1-2 мкл
6х краситель ДНК 1 мкл 0.5 мкл
Вода 3-4 мкл 0.5-1.5 мкл
6 мкл 3 мкл
Аккуратно перемешать
Шаг 2 Аккуратно перемешать Добавьте 1 мкл на 1 мм ширины полосы
Шаг 3 Добавить смесь на 5 мм полосы*

* При использовании 2 мкл ДНК-маркера используйте 3 мкл или 0,5 мкл воды с агарозным или полиакриламидным гелем соответственно.

** Для гелей с другой шириной пересчитайте смесь в большую или меньшую сторону; используйте 0,2-0,4 мкл (0,1-0,2 мкл) маркера ДНК на 1 мм полосы.

Рекомендации

  • Не нагревайте маркеры перед загрузкой на гель
  • Для получения правильной конечной концентрации красителя для загрузки образцов ДНК, смешайте один объем Thermo Scientific DNA Loading Dye, 6X (номер по каталогу R0611 (/reaktivy/reaktivy-fermentas/694/) или R0631 (/reaktivy/reaktivy-fermentas/696/), поставляется с маркером) с 5 объемами образца ДНК.
  • Загрузите соответствующие объемы образца ДНК и маркеры на гель.
  • Для количественной оценки отрегулируйте концентрацию образца ДНК таким образом, чтобы интересующая вас полоса по массе (нг) приблизительно соответствовала ближайшей полосе маркера.
  • Для визуализации полосы ДНК с помощью Invitrogen SYBR Green I Dye и других интеркаляционных красителей не добавляйте краситель к образцу; окрашивайте гель после электрофореза или включайте краситель в агарозный гель, чтобы избежать аберрантной миграции ДНК.

Важное примечание: для визуализации полосы ДНК с помощью краски GelRed, окрашивайте гель после электрофореза чтобы избежать аберрантной миграции ДНК.

Информация для заказа

 

Товар Количество Кат.номера
ДНК маркер 100 б.п. 50 мкг/5 x 50 мкг SM0241/SM0242
ДНК маркер 100 б.п., ready-to-use 50 мкг/5 x 50 мкг SM0243/SM0244
ДНК маркер 100 б.п. Plus 50 мкг SM0321/SM0322
ДНК маркер 100 б.п. Plus, ready-to-use 50 мкг/5 x 50 мкг SM0323/SM0324
ДНК маркер 1 кб 5 x 50 мкг/25 x 50 мкг SM0311/SM0312
ДНК маркер 1 кб, ready-to-use 50 мкг/5 x 50 мкг SM0314/SM0313
ДНК маркер 1 кб Plus 5 x 50 мкг/25 x 50 мкг SM1331/SM1332
ДНК маркер 1 кб Plus, ready-to-use 50 мкг/5 x 50 мкг SM1334/SM1333
ДНК маркер 50 кб 50 мкг/5 x 50 мкг SM0371/SM0372
ДНК маркер 50 кб, ready-to-use 50 мкг SM0373
ДНК маркер Mix 5 x 50 мкг/25 x 50 мкг SM0331/SM0332
ДНК маркер Mix, ready-to-use 50 мкг/5 x 50 мкг SM0334/SM0333
ДНК маркер Express, ready-to-use 50 мкг SM1553
ДНК маркер Ultra Low Range, ready-to-use 50 мкг SM1213
ДНК маркер Low Range, ready-to-use 50 мкг SM1193
ДНК маркер High Rang, ready-to-use 50 мкг SM1353

Другие статьи